2013年11月，黨的十八屆三中全會發布《中共中央關于全面深化改革若干重大問題的決定》，為國企深化改革拉開了序幕。業內人士認為，目前國內醫藥行業主體和領導企業還是國有企業。進行混合所有制改革，可以避免單一產權結構下的諸多問題，盤活國有資產，提升其市場價值。
　　據Wind數據，實際控制人為國務院國有資產監督管理委員會的A股醫藥行業上市公司包括：華潤旗下華潤三九、華潤雙鶴、東阿阿膠、華潤萬東，國藥系包括國藥股份、國藥一致、天壇生物、現代制藥，通用系下中國醫藥。此外，實際控制人為地方國有資產監督管理委員會等相關部門的上市藥企包括上海醫藥、白云山、云南白藥、華北制藥、哈藥股份等40家，另外還有5家高校企業，包括北大醫藥、交大昂立、紫光古漢、山大華特、達安基因。
　　數據顯示，2014年前三季度，這54家國企實現凈利潤為131.18億元，而同期188家上市藥企總計實現利潤378.25億元。這意味著54家國字藥企實現的凈利潤僅占該行業上市公司利潤總和的34%。如何盤活這類企業的營運能力仍是市場關注的焦點。
　 2014年7月15日，國務院國資委通報了關于國資國企改革試點的有關情況。根據試點工作需要，國資委選擇了中國醫藥集團總公司（簡稱：國藥集團）作為發展混合所有制經濟試點和董事會行使高級管理人員選聘、業績考核和薪酬管理職權試點。據了解國藥集團旗下A股上市公司國藥股份、國藥一致、天壇生物、現代制藥這四家上市公司。
　　國藥集團表示，已經實現混合所有制的子企業，要在股權層面改革的基礎上，進一步完善公司的法人治理結構，完善激勵和約束相結合的管理體制。此外，要加快推進集團內沒有實現混合所有制改革全資子企業盡快改革。通過這次試點，激發企業的活力和市場競爭力，保障企業按市場規則獨立自主經營，保障國有資產的保值增值。
　　相關人士透露，國藥集團已經對部分二級公司進行了股份制改造，改進了企業法人治理結構。國藥集團旗下非上市公司或將成為重點。據了解，國藥集團旗下還有11家非上市公司，包括中國生物技術股份有限公司、中國醫藥工業研究總院、中國國際醫藥衛生公司、中國科學器材公司等。
　　值得注意的是，除了資產注入的預期外，市場預期國字藥企進行整合的可能性很大，而先前這類案例并不少。如通用系（中國通用技術控股集團）旗下兩家上市公司天方藥業和中國醫藥已經完成合并，中國醫藥將作為通用旗下醫藥資產的整合平臺。華潤集團曾欲整合旗下醫藥資產，籌劃華潤雙鶴、華潤三九資產重組。雖然此項重組最終告吹，卻對外透露了一個訊息，那就是華潤集團旗下資產仍有整合可能。
　　此外，2013年，廣州市國有資產監督管理委員會旗下兩大醫藥上市公司廣州藥業和白云山進行合并，欲打造千億級龍頭企業；重慶市涪陵區國有資產監督管理委員會旗下三家上市公司太極集團、西南藥業、桐君閣之間的整合也引起市場廣泛關注。